Frostmusterböden entstehen durch Bewegung der Lockermaterialdecke unter dem Einfluss von Permafrost. Durch Permafrost im Untergrund ist die Wasserversickerung der sommerlichen Auftauschicht stark eingeschränkt, wodurch eine hohe Wassersättigung in der Auftauschicht (active layer) resultiert. Zum Winter hin friert diese Auftauschicht von oben nach unten wieder. Dadurch entsteht ein Auflastdruck im Bereich zwischen dem Permafrost im Untergrund und der wiedergefrorenen Schicht des Oberbodens. Da das Substrat wassergesättigt ist, kommt es zum Auspressen des schlammigen Feinbodenmaterials durch Spalten und Risse an die Oberfläche. Durch die vielfache Wiederholung dieses Prozesses über viele Auftau- und Gefrierzyklen hinweg, wird die gesamte active layer durchmischt und die ursprünglich horizontalen Bodenhorizonte verbogen bzw. auseinander gerissen.